ชาโดว์แดนเซอร์: เดอะซีเครตออฟชิโนะบิ ได้รับการตอบรับในทางที่ดี นิตยสารเมกะ ได้จัดให้เกมนี้อยู่ในอันดับที่ 33 ของสุดยอดเกมเมกะไดร์ฟตลอดกาล[7] ใน ค.ศ. 2008 บล็อกจอยสติค ได้กล่าวถึงเดอะซีเครตออฟชิโนะบิ ว่า "มีการเปิดตัวที่น่ายำเกรงที่สุด" ในแฟรนไชส์ชิโนะบิ ที่มีอยู่ทั้งหมด และเพิ่มเติมถึงเกมว่า "เป็นการแสดงถึงสิ่งที่มีมากกว่าการเป็นนินจาสะกดรอยไปตามเมืองที่เป็นผืนทราย นั่นคือสุนัขนินจา"[8] ตามคำวิจารณ์ของเวอร์ชวลคอนโซลโดยเว็บนินเทนโดไลฟ์ในปี ค.ศ. 2012 ได้กล่าวว่า "ขอแนะนำให้แก่บรรดาเหล่าแฟนเกมนินจาทั้งหมด"[9]